1941年，新昌刘门坞村遭受日军焚烧抢劫，时年22岁的吴显超凭着一股爱国热情，变卖家产，自发组建了一支地方武装。该武装拥有50余人，机枪2挺，步枪30余支，驳壳枪8支，成员大部分是本乡本土的青壮年农民，也有国民党军队和伪军出身的散兵游勇。他们虽然经历不同，遭遇各异，但是爱国爱乡，不愿做亡国奴，一听打日本就能聚集起来，作战勇敢，不怕牺牲，很受当地群众拥护，并很快接受了中共新昌地方组织的领导，史称“显超部队”。
    1942年7月，新昌县城沦陷，日军在新奉公路沿线西山、曹州、竹岸、沙溪等地及三溪大桥设立据点。新昌县当局退踞儒岙一隅，县政府迁至报国里桥，国民党县党部移居屯坑村。中共浙东区委根据抗战形势的变化，确定以“筹建壮大武装部队，开展敌后抗日游击战争”为中心任务。吴显超根据浙东区委的指示，带领部队在公路沿线设路障、炸桥梁、割电线、截汽车，神出鬼没频繁出击，组织了多次很有影响的战斗，队伍也迅速壮大起来。
    1943年8月6日晚，吴显超率部进入青横柴沿附近的王家年设伏，次日中午敌人进了伏击圈，游击队员一齐开火，打得敌人懵头转向。此战斗打死打伤敌人7名，有力地打击了敌人的嚣张气焰，此后小股日军再也不敢轻易出城活动。战后，吴显超光荣地加入中国共产党。
    1944年4月，为了狠狠打击敌人，吴显超经报请上级批准，决定搞一次虎口拔牙——袭击新昌县城西门。根据侦察，西门口驻有一个伪军班，由一个日军带领。部队挑选了10名战士，组成便衣分队，化装成赶集的农民。4月17日深夜出发，次日上午七八点钟到达西门口。部队迅速解决伪军岗哨，控制城门口，冲进伪军驻地。谁知室内只有一个企图顽抗的伪军，那个日本兵和其他人员都出城扫荡了。吴显超立即指挥部队撤出战斗，队伍无一伤亡。此次行动，尽管只击毙2名伪军，缴获2支步枪，但游击队员大白天敢于在县城西门动手，对敌人的心理震慑很大。吴显超又趁机散发传单，进行宣传教育，没过几天，就有一个伪军班的7名士兵向显超部队反正。1944年9月中下旬，吴显超根据情报，又对出东门扫荡和零散外出的日军进行了几次有效的伏击，击毙击伤多名日军。
    平时，吴显超的部队都驻在崇山峻岭之中，外出活动无规律可寻，日军对此毫无办法。有一天，西山据点的日军通过分水乡长许湘法，竟然主动上门来“求和”，要求游击队不再破坏新昌、拔茅、西山间的公路和电话线，还带来了一些食品等。吴显超想，小鬼子一向不可一世，不把我们游击队放在眼里，这次竟然这么“客气”，上门送礼求和，说明鬼子的气数将尽，咱们要趁机再加把劲，给鬼子也“回敬”一下。他把许湘法找来，交给他一包装有定时雷管的炸药包，要他秘密送进西山敌炮楼。许湘法尽管一万个不愿意，但他中国人的良心还在，加之他平时非常佩服显超部队的抗战义举，所以硬着头皮去西山据点“送礼”。但由于他没有受过严格的军事训练，将炸药带进西山据点后，在炮楼下转了好几圈，因为有敌人在场而无机可乘。眼看定时器将要引爆，他便将炸药包放在食堂墙角，炸塌了食堂，遗憾的是不在开饭时间，没有炸死日军，但吓得日军几天不敢动弹。
    1945年1月，有内部情报显示，国民党当局企图借“剿匪”为名，调显超部队去琅珂，趁机消灭之。得悉情报后，吴显超立即向四明山总部汇报，总部闻讯而动，派出接应部队前出，把这支屡建奇功的抗日武装顺利拉上四明山。
    吴显超的部队立即汇入了革命的洪流，改编为新四军浙东游击纵队四明自卫总队新昌大队，吴显超任大队长，同年5月改编为新四军浙东游击纵队四支队二大队。部队先后参加嵊东祝家庙战斗、晋溪战斗、鄞西鄞江桥战斗、奉化江口战斗和宁波战斗等。
    1945年10月，吴显超随新四军浙东游击纵队北撤，先后任新四军浙东纵队第一纵队第三旅九团二营营长、华东野战军第一纵队三旅九团作战参谋、三师八团作战参谋、八团二营营长等职。其间，先后参加苏北战役、鲁南战役、孟良崮战役、鲁西南突围、豫东战役、淮海战役、渡江战役、解放上海战役等。1950年2月，吴显超调华东军区情报部工作。
    吴显超在战斗中曾三次负伤，1957年被授予三级解放勋章，1960年被授予中校军衔，1982年离休，1988年被授予独立功勋荣誉奖章。